2006年10月建成苏州博物馆新馆，设计者为着名的建筑设计大师贝聿铭。馆址为太平天国忠王李秀成王府遗址。面积8000多平方米，分东、西、中3路，中路立体建筑为殿堂型式，梁坊满饰苏式彩绘，入口处侧门，有文征明手植紫藤，内部东侧有太平天国古典舞台等，是全国重点文物保护单位。

苏州博物馆新馆选址位于历史保护街区范围，紧靠世界文化遗产拙政园和全国重点文物保护单位太平天国忠王府。具体在忠王府以西，东北街以北，齐门路以东和拙政园以南地块，占地面积约10750平方米。该地块被贝聿铭先生称为“圣地”,在这一地块上设计博物馆是“人生最重要的挑战”,“在这里设计博物馆很难很难，既要有传统的东西，但又一定要有创新，传统的东西就是要运用传统的元素，让人感到很协调、很舒服；创新的东西就是要运用新的理念、新的方法，让人感到很好看，有吸引力，因为时代是在发展的”.按照贝聿铭先生的设计思想和专家组提出的“中而新，苏而新”的设计思路，经过一年的紧张工作，先后完成了概念性方案设计和初步设计。

2006年，由国际建筑大师贝聿铭担纲设计的苏州博物馆新馆正式对外开放，江南一隅的这栋建筑吸引了全世界的目光，更让无数建筑爱好者为之疯狂。读者shuangying1228在来信中自称已去过苏博9次，每次都是一趟心灵的震撼和涤荡，他说，“苏博首先是一座数字化博物馆的精品之作，她的风格、气派、内部功能的先进、运作程序的完善、布局安排的科学，都闪烁着现代建筑的光辉；同时她又是一座扩大了的中国庭院，一座别具一格的苏州园林。就连馆中两丛藤蔓，都专选江南四杰文征明手植紫藤的根来嫁接，中华文明的信息无不在其间流淌传承。”

随着苏博新馆揭开面纱，那些曾因选址问题而引发的争议很快消散，“非但没有对那些历史遗迹造成伤害，更水乳交融、相得益彰。”这成了游客们最普遍的观感。偌大一个博物馆，东邻太平天国忠王府，北依名胜极品拙政园，西南面对千年古城的小桥流水人家、粉墙黛瓦院落。其风韵，其神采，其姿色浑然一体。现代流派的苏州博物馆，不仅是建筑设计的奇迹，也是一种人性关怀和民族亲情的彰显。